L’INI ha attivi al suo interno un Consiglio scientifico e varie Unità di ricerca e sperimentazione che operano in stretto collegamento con varie Università e Associazioni formative.

• Presso INI Divisione Grottaferrata sono attive le seguenti convenzioni universitarie:
  
  - Università degli Studi di Roma "La Sapienza"
  
  Scuola di specializzazione in Chirurgia dell'apparato digerente
  Scuola di specializzazione in Geriatria
  Scuola di specializzazione in Neurofisiopatologia
  Scuola di specializzazione di Oncologia II
  Scuola di specializzazione in Radiologia
  
  - Università Pontificia Salesiana
  
  Scuola di specializzazione in Psicologia clinica
  
  
• Presso INI Divisione Medicus sono attive le seguenti convenzioni:
  
  - Università degli Studi di Roma "La Sapienza"
  
  svolgimento in sede del "Corso universitario in Terapia occupazionale"
  
  
  - Azienda ospedaliera S. Andrea
  
  Convenzione per posto di ruolo professore di II^ fascia
  Accordo quadro per la sperimentazione organizzativa e gestionale
  
  
  - Università degli studi de L'Aquila
  
  Tirocini per gli iscritti alla facoltà di Scienze motorie
  
  
  - C.E.S.I.D.
  
  Convenzione per tirocini formativi settore sociale R.S.A.
  
  
  - S.I.A.B.
  
  Convenzione per tirocinio di formazione degli allievi
  
  
• Presso INI Divisione Villa Dante sono attive le seguenti convenzioni universitarie:
  
  - Università degli Studi di Roma "La Sapienza"
  
  Dottorato di ricerca Genetica medica
  
  
•  Presso Villa Alba Fonte Nuova sono attive le seguenti convenzioni universitarie:
  
  - Università degli Studi di Roma "La Sapienza"
  
  Dottorato di ricerca Genetica medica
  Tirocinio per tesi di laurea per studenti della Facoltà di Medicina e chirurgia - Corso di Neuro e Psicomotricità dell'età evolutiva
  
  - Università degli Studi di Roma "Tor Vergata" Polo Universitario di Tivoli, Corso di laurea in Fisioterapia
  
  Tirocinio per studenti del Corso di Laurea in Fisioterapia
  
  - A.S.P.I.C.
  
  Tirocinio di specializzazione quadriennale in Psicologia clinica di Comunità
  
   Tirocinio di specializzazione quadriennale in Psicoterapia Umanistica integrata
  
  
  - A.R.P.C.I. (Associazione per la ricerca in Terapia cognitivo-interpersonale
  
  Tirocinio di specializzazione in Psicoterapia
  
  
  - Scuola di Psicoterapia cognitiva
  
  Tirocinio di specializzaione in psicoterapia